通常冷冻卵子流程如下：女性在医疗机构的体检后，按规定口服或注射促排卵药物，促使卵巢内多颗卵子同时成熟，使用药物的10-12天后，医生会使用穿刺针在B超引导下，通过阴道穿刺取出卵巢内成熟的卵子，数量为10个左右。
目前的医疗水平也可以做到无痛，全程不超过30分钟。接下来医生将取出的卵子进行玻璃化冷冻(把卵子放进高度浓缩的脱水冷冻保护溶液，然后立即投入零下196℃的液氮中保存。当需要使用卵子时，就从液氮中取出卵子，使用药剂进行复原。
冻卵一般需要多少颗卵子：
促排、取卵具有个体差异。如果卵巢功能良好，卵子优质可以一次获得足够数量，但是如果卵巢功能不良，则需要多次取卵。根据2016年《生育与不孕》一项基于1805名25至42岁冻卵女性与卵子解冻复苏、活产率的研究，建议25岁至30岁的女性冻卵12至18颗；30岁至35岁的女性冻卵18至20颗；35至40岁女性冻卵20至24颗，40岁以上的女性冻卵30颗以上，可以保证未来卵子解冻复苏、活产率在80%左右。
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