据各国医疗专家多年跟踪研究表明，通过第三代试管助孕的婴儿和普通自然受孕的婴儿没有健康上的差异。

在身体，心理，智力及社交能力发展方面都很正常，因可以进行胚胎的择优选择，第三代的试管婴儿更提高了优生优育的目的，并且可以轻松选择双胞胎、龙凤胎或男女宝宝，与自然妊娠分娩的宝宝相比，第三代试管宝宝的先天缺陷发生率明显减少。

如果还是要比较试管婴儿和普通婴儿的区别，那唯一的不同便是受孕方式了。
 

自然受孕是精子和卵子在输卵管中相遇，经由输卵管输送到子宫内着床发育;而试管婴儿的胚胎是将母亲的卵子与父亲的精子分别取出后体外精，若受精卵形成且发育正常，则再将其转移到含生长液的培养皿内继续培养后形成囊胚，第五天即可知道胎儿性别，同时进行PGS\PGD的筛查诊断，第六天将最为优质的囊胚移植到母亲子宫腔，进而和自然受孕的宝宝一样经过十个月的生长发育，直至分娩。

所以，试管婴儿和自然怀孕的宝宝相比只是受孕方式不同，而通过第三代的试管婴儿技术挑选出来的宝宝更优于自然生育的普通宝宝，其它没有本质上差别。