一旦形成一个微小的开口，通过移液管抽吸除去待测细胞，或轻轻挤压胚胎，直到几个细胞通过破裂的开口出来。
胚胎的活组织检查可在受精后三天或五天进行。各有利弊。
第3天胚胎活组织检查：第3天的胚胎称为卵裂球。它只有六到九个细胞。只在一个细胞上进行基因筛查是可能的，但服用两个更好。
进行第3天活组织检查的最大优点之一是可以及时进行测试，以便在取卵后第5天进行新鲜胚胎移植。这意味着更少的等待时间和更低的成本（因为您可能不需要支付冷冻胚胎转移费用。）
然而，一些研究发现，在这个阶段对一个以上细胞进行活组织检查会增加“胚胎停滞”的风险。胚胎可能会停止发育，不能再转移。这种情况很少见，但仍有可能需要考虑。此外，第3天活组织检查发现假阳性和包容性结果的风险更大。
第5天胚胎活检：第5天胚胎被称为胚泡。在这个阶段，胚胎有数百个细胞。这些细胞中的一些将成为胎儿，其他细胞将成为胎盘。胚胎学家可以采取更多的细胞进行测试 - 通常需要5到8个 - 这样可以更好地诊断并减少不确定的结果。采取的细胞是注定要成为胎盘的细胞; 胎儿细胞不受影响。
第5天活组织检查的缺点是并非所有胚胎在实验室环境中存活这么多天，即使是其他健康的胚胎也是如此。
此外，第5天活组织检查需要将胚胎冷冻保存直至结果恢复。这意味着女性至少需要等到下个月进行胚胎移植。这将是一个冷冻胚胎转移周期。这意味着额外的等待时间和额外费用。还存在胚胎在冷冻和解冻时不能存活的风险。
然而，在这个过程之后，只有最强的胚胎仍然存在。那些存活并具有良好PGS结果的人甚至更有可能获得健康的结果。
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